怒斥了諸將的驕矜之心之后，李自成正式做出東征滅明的戰略部署：
李自成自領一路大軍，率領劉宗敏，李過等將領自西安出發，經潼關東出進入山西，在李自成的預想中，這一路將是最艱難的一路；
另一路大軍由劉芳亮，袁宗第率領，進入河南，準備進軍山東，阻斷北京和南方的聯系，另外，李自成還派出賀珍率兵南下漢中，防止張獻忠渾水摸魚。
做好軍事準備之后，李自成隨即令李巖，牛金星撰寫討明檄文：
“自古帝王興廢，民兆于心。嗟爾明朝，大數已終。嚴刑重斂，民不堪命。誕我圣主，體仁好生。義旗一舉，海宇歸心。渡河南而削平豫楚，入關西而席卷三秦。安官撫民，設將防邊，大業已定。天可憐見大明兵民，久困湯火，不忍坐視，故天降我主，解民于水火，故君等當順天惜民，審時度勢，獻城納印，早圖爵祿。如執迷相拒，許爾紳民縛獻，不惟倍賞，且保各處生靈。如官民共抗，兵至城破，玉石不分，悔之何及！”
李自成看過檄文之后覺得沒有什么問題便批了一個“可”，隨即順軍諸部在西安誓師祭天，順軍浩浩蕩蕩從西安出發，向著京師進發。
與此同時，北京的明廷磨蹭良久卻沒商量出個所以然來：
在先前崇禎帝發出詔書要求進擊李自成的三部人馬之中，左良玉最為跋扈：
左良玉直接以防范李自成南下江南為由拒絕了朝廷的征召。
山東的劉澤清倒是奉命了，但他走了不到百里路就派人急匆匆向朝廷發來文書聲稱他在行軍路上戰馬突然馬失前蹄導致摔斷了腿，無法指揮軍隊，因此不得不將進軍時間往后大幅度拖延。。
至于唐通和白廣恩兩人，這兩人走了半天愣是沒有走出自家轄區，仿佛是烏龜在行軍一般。
這下子崇禎帝終于看清楚了：
合著這群人沒有一個是真的有心來打仗的！
沒辦法，崇禎帝終于想起了陳新甲的建議，他這次直接甩出了大手筆：
崇禎帝下旨晉升李子明為河南，山東，北直隸，陜西，山西五省總理，總覽五省軍務，五省總督、巡撫均需向其負責，并且封遼陽侯，賜尚方寶劍；吳三桂晉升為遼東總督，封寧遠伯，著令兩人即刻領遼兵入關剿賊。
崇禎帝下令草擬詔書之后王承恩來報左中允李明睿求見，崇禎帝有些奇怪，李明睿算是一個掮客，有些話作為緩沖必須由他向皇帝說明，他現在突然求見，一定是有什么官員想說些什么。
于是崇禎帝同意了李明睿的覲見，而李明睿一見到崇禎帝便立刻說道：
“陛下，闖賊來勢洶洶，各地援軍需要時間才能集結，為免出現最壞情況，臣懇請陛下南幸，待諸軍剿滅闖賊，再行北上。”
崇禎帝聞言愣了半晌，他沒想到李明睿居然說的是這件事！
過了半晌，崇禎帝露出了猶豫的神色，說道，“朕在北京，北方諸軍尚且跋扈難調，若朕南幸，北方諸軍若投敵，何如？”
李明睿說道，“大明尚在，諸軍能投敵者不過山西兵而已，臣已探知，遼東銀錢十之六七來自南方，陛下南幸，能更好地掌控東南，掌控東南的話，李子明必不會反，李子明在則遼兵尚在，闖賊斷然不能全取北方。”
崇禎帝聽了李明睿的話之后沉默了一陣，接著他說道，“除了你，還有誰是這么想的？”
李明睿說道，“南幸之意正是左都御史李邦華告訴臣的，另外，戶部尚書倪元璐，戶部侍郎蔣臣，兵部尚書陳新甲皆贊同陛下南幸。”
崇禎帝聽罷嘆了口氣，說道，“不夠呀。”
李明睿頓時大急，說道，“陛下，須知天命微密，當內斷圣心，此事陛下乾綱獨斷即可，何必顧慮群臣。”
崇禎帝最終沒有做出表態，李明睿頓感無奈，只得和崇禎帝表示他會和李邦華一起在朝會上提出南遷的方案。
次日，崇禎帝隨即召開朝會，討論如何應對來勢洶洶的大順軍：
李邦華當即出列說道，“闖賊來勢洶洶，山西必不可守，山西一失，則大同宣府亦難保，大同宣府不保，則京師危矣，為天下計，臣懇請陛下南幸南直隸，待遼兵入關擊退闖賊再做他算。”
李邦華話剛說完，兵科給事中光時亨立刻說道，“昔日瓦剌圍京師，奸臣欲令帝難逃，于少保言【欲南逃者皆國賊也】，李御史，你身為左都御史，竟欲使陛下南逃，是何居心？”
李邦華大怒，光時亨偷換概念，把南遷說成了南逃，他說道，“是南幸不是南逃，當此時，陛下安危……”
光時亨打斷了李邦華的話，說道，“陛下若走，北方軍民必亂，則半壁江山不復我大明所有，李御史你這是收了李自成五十萬兩銀子？”
李邦華氣得說不出話來，大學生陳演，魏德藻也出列說道，
“陛下，此時斷不能南遷，若是陛下南下，北方官軍必蜂擁降賊，南方官軍戰力遠不如北方，若闖賊攜北方叛軍南下，那我大明才是真的完了！”
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